平成18年（2006年）内閣府
| 一-六 | 1月13日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 七-一九 | 1月13日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 二〇 | 1月30日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 二一-二三 | 2月8日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 二四-二六 | 2月8日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 二七 | 2月10日 | 犯罪被害者等基本計画を定めた件 |
| 二八-二九 | 2月20日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 三〇 | 2月20日 | 日本海溝・千島海溝周辺海溝型地震防災対策推進地域を指定した件 |
| 三一 | 2月20日 | 道路交通法施行規則第三十三条第四項第一号ハの規定により内閣総理大臣が指定する模擬運転装置及び同号ニの規定により内閣総理大臣が指定する無線指導装置の一部を改正する件 |
| 三二 | 3月2日 | 男女共同参画基本計画を変更した件 |
| 三三-四二 | 3月13日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 四三-五二 | 3月13日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 五三 | 3月31日 | 災害対策基本法第二条第五号の規定により内閣総理大臣が指定する指定公共機関の件の一部を改正する件 |
| 五四 | 3月31日 | 租税特別措置法施行令第五条の十一第二項第一号及び第二十八条の四第二項第一号の規定に基づき内閣総理大臣が指定する区域を定めた件の一部を改正する件 |
| 五五 | 3月31日 | 防衛施設周辺の生活環境の整備等に関する法律の規定に基づき特定防衛施設及び特定防衛施設関連市町村を指定した件の一部を改正する件 |
| 五六 | 4月3日 | 東海地震に係る地震防災対策強化地域を指定した件 |
| 五七 | 4月3日 | 東南海・南海地震防災対策推進地域を指定した件 |
| 五八 | 4月3日 | 日本海溝・千島海溝周辺海溝型地震防災対策推進地域を指定した件 |
| 五九-八二 | 4月14日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 八三-九四 | 4月14日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 九五-二三二 | 4月18日 | 構造改革特別区域計画を認定した件 |
| 二三三-二四七 | 4月18日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 二四八-二五三 | 4月18日 | 構造改革特別区域計画の認定を取り消した件 |
| 二五四-三九三 | 4月18日 | 地域再生計画を認定した件 |
| 三九四-五五九 | 4月18日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 五六〇-五六五 | 4月18日 | 地域再生計画の認定を取り消した件 |
| 五六六 | 5月31日 | 漁船の操業を制限し、又は禁止する区域及び期間並びにその条件を定める件 |
| 五六七-五七三 | 6月7日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 五七四-五七八 | 6月7日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 五七九 | 6月21日 | 漁船の操業を制限し、又は禁止する区域及び期間並びにその条件を定める件 |
| 五八〇 | 7月5日 | 内閣府本府の保有する行政文書の開示に係る権限又は事務の一部について委任した件の一部を改正する件 |
| 五八一 | 7月5日 | 内閣総理大臣の所掌に係る行政機関の保有する個人情報の保護に関する法律第四章第一節から第三節までに定める権限又は事務の一部について委任した件の一部を改正する件 |
| 五八二 | 7月10日 | 競争の導入による公共サービスの改革に関する法律施行令第一条第一項に規定する電磁的記録について定める件 |
| 五八三-六一三 | 7月27日 | 構造改革特別区域計画を認定した件 |
| 六一四-六二一 | 7月27日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 六二二-七〇九 | 7月27日 | 構造改革特別区域計画の認定を取り消した件 |
| 七一〇-七八六 | 7月27日 | 地域再生計画を認定した件 |
| 七八七-八一六 | 7月27日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 八一七-八二〇 | 8月7日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 八二一 | 8月7日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 八二二 | 9月22日 | 漁船の操業を制限し、又は禁止する区域及び期間並びにその条件を定める件 |
| 八二三 | 9月25日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 八二四 | 9月25日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 八二五-八五六 | 12月4日 | 構造改革特別区域計画を認定した件 |
| 八五七-八六八 | 12月4日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |
| 八六九 | 12月4日 | 構造改革特別区域計画の認定を取り消した件 |
| 八七〇-八九九 | 12月4日 | 地域再生計画を認定した件 |
| 九〇〇-九二五 | 12月4日 | 地域再生計画の変更を認定した件 |
| 九二六 | 12月4日 | 地域再生計画の認定を取り消した件 |
| 九二七 | 12月8日 | 東南海・南海地震防災対策推進地域を指定した件 |
| 九二八 | 12月13日 | 保険業法第百八十五条第一項の免許に関する件 |
| 九二九-九三三 | 12月27日 | 構造改革特別区域計画の変更を認定した件 |