平成18年（2006年）厚生労働省
厚生労働省・農林水産省
| 一 | 11月22日 | 食品の製造過程の管理の高度化に関する臨時措置法第十七条の規定に基づく指定認定機関の事務所の所在地の変更の件 |
| 二 | 11月22日 | 食品の製造過程の管理の高度化に関する臨時措置法第十八条の規定に基づく認定業務規程の変更を認可した件 |
厚生労働省・農林水産省・経済産業省
| 一 | 2月1日 | 両筑平野用水二期事業に関する事業実施計画を認可した件 |
厚生労働省・経済産業省
| 一 | 4月20日 | 日本工業規格への適合性の認証に関する省令第二条第二項第一号の規定に基づき鉱工業品及び品質管理の規格を定める件 |
| 二 | 8月18日 | 中小企業の新たな事業活動の促進に関する法律第二条第九項の規定に基づき平成十八年度予算に係る特定補助金等を指定する件 |
| 三 | 9月20日 | 中小企業における労働力の確保及び良好な雇用の機会の創出のための雇用管理の改善に係る措置に関する基本的な指針の一部を改正する件 |
厚生労働省・経済産業省・環境省
| 一 | 1月13日 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律第二条第四項の規定に基づき化学物質を第一種監視化学物質として指定した件 |
| 二 | 7月14日 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律第二条第五項の規定に基づき化学物質を第二種監視化学物質として指定した件 |
| 三 | 11月10日 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律第四条第一項の規定に基づき化学物質を同項第三号に該当すると判定した件 |
厚生労働省・環境省
| 一 | 2月10日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認の件 |
| 二 | 11月13日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認の件 |