平成18年（2006年）農林水産省
農林水産省・経済産業省
| 一 | 8月18日 | 中小企業の新たな事業活動の促進に関する法律第二条第九項の規定に基づき平成十八年度予算に係る特定補助金等を指定する件 |
| 二 | 10月26日 | 商品取引所法第百四十五条第二項の規定による商品取引所の合併の認可の申請に伴い商品取引所法第三百五十二条の規定に基づき公示する件 |
| 三 | 12月25日 | 商品取引所法第百四十五条第一項の規定に基づき、商品取引所の合併について認可した件 |
農林水産省・経済産業省・国土交通省
| 一 | 5月26日 | 民間事業者の能力を活用して特定施設の整備を促進するための基本的な指針（民間事業者の能力の活用による特定施設の整備の促進に関する臨時措置法第二条第一項第十一号ロに掲げる特定施設関係）及び民間事業者の能力を活用して特定施設の整備を促進するための基本的な指針（民間事業者の能力の活用による特定施設の整備の促進に関する臨時措置法第二条第一項第十五号に掲げる特定施設関係）を廃止する告示 |
農林水産省・経済産業省・国土交通省・環境省
| 一 | 5月26日 | 民間事業者の能力を活用して特定施設の整備を促進するための基本的な指針（民間事業者の能力の活用による特定施設の整備の促進に関する臨時措置法第二条第一項第十六号イの政令で定める施設として民間事業者の能力の活用による特定施設の整備の促進に関する臨時措置法施行令第一条第二号に掲げる特定施設関係）を廃止する告示 |
農林水産省・経済産業省・環境省
| 一 | 5月17日 | 容器包装に係る分別収集及び再商品化の促進等に関する法律第十八条第一項の規定に基づく自主回収の認定に関して公示する件 |
| 二 | 5月17日 | 容器包装に係る分別収集及び再商品化の促進等に関する法律第十八条第一項の規定に基づく自主回収の認定の取消しに関して告示する件 |
農林水産省・国土交通省
| 一 | 3月31日 | 海岸法の規定による海岸保全施設の管理の所掌の方法についての協議が成立した件 |
| 二 | 5月26日 | 民間事業者の能力を活用して特定施設の整備を促進するための基本的な指針（民間事業者の能力の活用による特定施設の整備の促進に関する臨時措置法第二条第一項第十号イに掲げる特定施設関係）等を廃止する告示 |
農林水産省・環境省
| 一 | 1月24日 | 外国の証明書発行機関を定める件の一部を改正する件 |
| 二 | 1月25日 | 環境大臣及び農林水産大臣が所掌する特定外来生物に係る特定飼養等施設の基準の細目等を定める件の一部を改正する件 |
| 三 | 2月1日 | カニクイアライグマの防除に関する件 |
| 四 | 2月22日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 五 | 3月22日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 六 | 4月21日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 七 | 5月19日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 八 | 6月7日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 九 | 6月21日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 一〇 | 7月12日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 一一 | 8月17日 | 外国の証明書発行機関を定める件の一部を改正する件 |
| 一二 | 10月3日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |
| 一三 | 12月4日 | 遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律に基づく第一種使用規程の承認をした件 |