平成16年（2004年）人事院規則
| 一二-〇-一三 | 2月27日 | 人事院規則一二-〇（職員の懲戒）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二-四五 | 3月1日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-五〇 | 3月1日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-九四 | 3月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四九-二六 | 3月1日 | 人事院規則九-四九（調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-六九 | 3月1日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇二-三 | 3月1日 | 人事院規則九-一〇二（研究員調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-四一 | 3月5日 | 国立大学法人法等の施行に伴う関係人事院規則の整備に関する人事院規則 |
| 一-三九-一 | 3月24日 | 人事院規則一-三九（構造改革特別区域における人事院規則の特例に関する措置及びその適用を受ける特定事業）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七〇 | 3月24日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-七三 | 3月25日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 一二-〇-一四 | 3月31日 | 人事院規則一二-〇（職員の懲戒）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-五-一三 | 4月1日 | 人事院規則一-五（特別職）の一部を改正する人事院規則 |
| 二-三-二五 | 4月1日 | 人事院規則二-三（人事院事務総局等の組織）の全部を改正する人事院規則 |
| 九-二-四六 | 4月1日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-五一 | 4月1日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-七-一〇 | 4月1日 | 人事院規則九-七（俸給等の支給）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-五一 | 4月1日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-九五 | 4月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二四-一〇-一 | 4月1日 | 人事院規則九-二四-一〇（人事院規則九－二四（通勤手当）の一部を改正する人事院規則）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-三〇-五一 | 4月1日 | 人事院規則九-三〇（特殊勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四〇-二二 | 4月1日 | 人事院規則九-四〇（期末手当、勤勉手当及び期末特別手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四九-二七 | 4月1日 | 人事院規則九-四九（調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七一 | 4月1日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇三-五 | 4月1日 | 人事院規則九-一〇三（暫定筑波研究学園都市移転手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一五-一四-一三 | 4月1日 | 人事院規則一五-一四（職員の勤務時間、休日及び休暇）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-〇-四一 | 4月1日 | 人事院規則一六-〇（職員の災害補償）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-三-三三 | 4月1日 | 人事院規則一六-三（災害を受けた職員の福祉事業）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-五二 | 4月12日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四二-二一 | 4月26日 | 人事院規則九-四二（指定職俸給表の適用を受ける職員の俸給月額）の一部を改正する人事院規則 |
| 一一-八-一九 | 4月26日 | 人事院規則一一-八（職員の定年）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七二 | 4月28日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-七四 | 6月25日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 一二-〇-一五 | 6月30日 | 人事院規則一二-〇（職員の懲戒）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-九六 | 7月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四九-二八 | 7月1日 | 人事院規則九-四九（調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一〇-四-一二 | 8月2日 | 人事院規則一〇-四（職員の保健及び安全保持）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七三 | 9月15日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-三九-二 | 9月24日 | 人事院規則一-三九（構造改革特別区域における人事院規則の特例に関する措置及びその適用を受ける特定事業）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-七五 | 9月24日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 一二-〇-一六 | 9月30日 | 人事院規則一二-〇（職員の懲戒）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二-四七 | 10月1日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-五二 | 10月1日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-五三 | 10月1日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-九七 | 10月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-三〇-五二 | 10月1日 | 人事院規則九-三〇（特殊勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七四 | 10月1日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-〇-四二 | 10月1日 | 人事院規則一六-〇（職員の災害補償）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-四-二〇 | 10月28日 | 人事院規則一-四（現行の法律、命令及び規則の廃止）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-三四-三 | 10月28日 | 人事院規則一-三四（人事管理文書の保存期間）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二-四八 | 10月28日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五-四 | 10月28日 | 人事院規則九-五（給与簿）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-五三 | 10月28日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）等の一部を改正する人事院規則 |
| 九-七-一一 | 10月28日 | 人事院規則九-七（俸給等の支給）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-五四 | 10月28日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-三四-一九 | 10月28日 | 人事院規則九-三四（初任給調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四〇-二三 | 10月28日 | 人事院規則九-四〇（期末手当、勤勉手当及び期末特別手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四二-二二 | 10月28日 | 人事院規則九-四二（指定職俸給表の適用を受ける職員の俸給月額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七五 | 10月28日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八二-二 | 10月28日 | 人事院規則九-八二（俸給の半減）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇二-四 | 10月28日 | 人事院規則九-一〇二（研究員調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇三-六 | 10月28日 | 人事院規則九-一〇三（暫定筑波研究学園都市移転手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一一五 | 10月28日 | 平成十六年改正法附則第五項の規定による職務の級における最高の号俸を超える俸給月額を受ける職員の俸給の切替え等 |
| 一四-四-八 | 10月28日 | 人事院規則一四-四（営利企業への就職）の一部を改正する人事院規則 |
| 一四-八-五 | 10月28日 | 人事院規則一四-八（営利企業の役員等との兼業）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-〇-四三 | 10月28日 | 人事院規則一六-〇（職員の災害補償）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七六 | 11月10日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-七七 | 11月25日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-〇-四四 | 11月30日 | 人事院規則一六-〇（職員の災害補償）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-二-一〇 | 11月30日 | 人事院規則一六-二（在外公館に勤務する職員、船員である職員等に係る災害補償の特例）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-三-三四 | 11月30日 | 人事院規則一六-三（災害を受けた職員の福祉事業）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-九八 | 12月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-五-一四 | 12月13日 | 人事院規則一-五（特別職）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-七六 | 12月16日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 一〇-一一-三 | 12月28日 | 人事院規則一〇-一一（育児又は介護を行う職員の深夜勤務及び超過勤務の制限）の一部を改正する人事院規則 |
| 一五-一四-一四 | 12月28日 | 人事院規則一五-一四（職員の勤務時間、休日及び休暇）の一部を改正する人事院規則 |