平成16年（2004年）環境省令
| 一 | 1月30日 | 瀬戸内海環境保全特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二 | 3月12日 | 環境省所管に属する物品の無償貸付及び譲与に関する省令の一部を改正する省令 |
| 三 | 3月18日 | 化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律の規定に基づく立入検査をする環境省の職員の携帯する身分を示す証明書の様式を定める省令の一部を改正する省令 |
| 四 | 3月26日 | 自然環境保全法施行規則及び絶滅のおそれのある野生動植物の種の保存に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 五 | 3月26日 | 自然環境保全法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 六 | 3月29日 | 自然公園法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七 | 3月29日 | 環境省の所管する法令に係る行政手続等における情報通信の技術の利用に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 八 | 3月30日 | 廃棄物の処理及び清掃に関する法律施行規則及びポリ塩化ビフェニル廃棄物の適正な処理の推進に関する特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九 | 3月31日 | 環境省関係構造改革特別区域法第二条第三項に規定する省令の特例に関する措置及びその適用を受ける特定事業を定める省令の一部を改正する省令 |
| 一〇 | 3月31日 | 環境省関係構造改革特別区域法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一 | 4月1日 | 独立行政法人環境再生保全機構に関する省令 |
| 一二 | 4月1日 | 日本環境安全事業株式会社法施行規則 |
| 一三 | 4月1日 | 環境省組織規則の一部を改正する省令 |
| 一四 | 4月16日 | 鳥獣の保護及び狩猟の適正化に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一五 | 4月28日 | 環境省関係構造改革特別区域法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一六 | 5月31日 | 排水基準を定める省令の一部を改正する省令の一部を改正する省令 |
| 一七 | 6月30日 | 産業廃棄物収集運搬業の許可を要しない者に関する廃棄物の処理及び清掃に関する法律施行規則の特例を定める省令 |
| 一八 | 7月28日 | 廃棄物の処理及び清掃に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一九 | 8月16日 | 南極地域の環境の保護に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 二〇 | 8月24日 | 環境省関係構造改革特別区域法第二条第三項に規定する省令の特例に関する措置及びその適用を受ける特定事業を定める省令の一部を改正する省令 |
| 二一 | 8月27日 | 環境省関係構造改革特別区域法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二二 | 9月27日 | 廃棄物の処理及び清掃に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 二三 | 10月1日 | 環境省組織規則の一部を改正する省令 |
| 二四 | 10月27日 | 廃棄物の処理及び清掃に関する法律施行規則及び一般廃棄物の最終処分場及び産業廃棄物の最終処分場に係る技術上の基準を定める省令の一部を改正する省令 |
| 二五 | 11月30日 | 独立行政法人環境再生保全機構に関する省令の一部を改正する省令 |
| 二六 | 12月15日 | 廃棄物の最終処分場事業に係る環境影響評価の項目並びに当該項目に係る調査、予測及び評価を合理的に行うための手法を選定するための指針、環境の保全のための措置に関する指針等を定める省令の一部を改正する省令 |
| 二七 | 12月16日 | 自然公園法施行規則及び自然環境保全法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二八 | 12月17日 | 環境省関係構造改革特別区域法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二九 | 12月22日 | 環境省関係構造改革特別区域法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三〇 | 12月27日 | ダイオキシン類対策特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |