平成13年（2001年）農林水産省令
| 一 | 1月6日 | 農林水産省組織規則 |
| 二 | 1月6日 | 農林水産消費技術センター組織規則 |
| 三 | 1月6日 | 種苗管理センター組織規則 |
| 四 | 1月6日 | 家畜改良センター組織規則 |
| 五 | 1月6日 | 肥飼料検査所組織規則 |
| 六 | 1月6日 | 農薬検査所組織規則 |
| 七 | 1月6日 | 農業研究センター組織規則 |
| 八 | 1月6日 | 野菜・茶業試験場組織規則 |
| 九 | 1月6日 | 果樹試験場組織規則 |
| 一〇 | 1月6日 | 畜産試験場組織規則 |
| 一一 | 1月6日 | 草地試験場組織規則 |
| 一二 | 1月6日 | 家畜衛生試験場組織規則 |
| 一三 | 1月6日 | 農業試験場組織規則 |
| 一四 | 1月6日 | 農業生物資源研究所組織規則 |
| 一五 | 1月6日 | 蚕糸・昆虫農業技術研究所組織規則 |
| 一六 | 1月6日 | 農業環境技術研究所組織規則 |
| 一七 | 1月6日 | 農業工学研究所組織規則 |
| 一八 | 1月6日 | 食品総合研究所組織規則 |
| 一九 | 1月6日 | 国際農林水産業研究センター組織規則 |
| 二〇 | 1月6日 | 林木育種センター組織規則 |
| 二一 | 1月6日 | 森林総合研究所組織規則 |
| 二二 | 1月6日 | さけ・ます資源管理センター組織規則 |
| 二三 | 1月6日 | 水産研究所組織規則 |
| 二四 | 1月6日 | 養殖研究所組織規則 |
| 二五 | 1月6日 | 水産工学研究所組織規則 |
| 二六 | 1月6日 | 中央省庁等改革のための農林水産省組織関係命令の整備に関する命令 |
| 二七 | 1月6日 | 農林水産省定員規則 |
| 二八 | 1月17日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 二九 | 1月18日 | 農業委員会等に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 三〇 | 1月18日 | 競馬法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三一 | 1月25日 | 社会保障に関する日本国とグレート・ブリテン及び北部アイルランド連合王国との間の協定の実施に伴う農林漁業団体職員共済組合法の特例等に関する省令 |
| 三二 | 2月1日 | 漁港法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三三 | 2月16日 | 独立行政法人農林水産消費技術センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三四 | 2月16日 | 独立行政法人種苗管理センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三五 | 2月16日 | 独立行政法人家畜改良センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三六 | 2月16日 | 独立行政法人肥飼料検査所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三七 | 2月16日 | 独立行政法人農薬検査所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三八 | 2月16日 | 独立行政法人農業者大学校の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 三九 | 2月16日 | 独立行政法人林木育種センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四〇 | 2月16日 | 独立行政法人さけ・ます資源管理センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四一 | 2月16日 | 独立行政法人水産大学校の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四二 | 2月16日 | 独立行政法人農業技術研究機構の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四三 | 2月16日 | 独立行政法人農業生物資源研究所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四四 | 2月16日 | 独立行政法人農業環境技術研究所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四五 | 2月16日 | 独立行政法人農業工学研究所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四六 | 2月16日 | 独立行政法人食品総合研究所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四七 | 2月16日 | 独立行政法人国際農林水産業研究センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四八 | 2月16日 | 独立行政法人森林総合研究所の業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 四九 | 2月16日 | 独立行政法人水産総合研究センターの業務運営並びに財務及び会計に関する省令 |
| 五〇 | 2月26日 | 農地法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五一-五二 | 3月7日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 五三 | 3月8日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五四 | 3月9日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 五五 | 3月19日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五六 | 3月19日 | 加工原料乳生産者補給金等暫定措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五七 | 3月19日 | 農畜産業振興事業団法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五八 | 3月22日 | 農林水産省の所管する独立行政法人に対し立入検査をする農林水産省の職員が携帯すべき身分証明書の様式を定める省令 |
| 五九 | 3月22日 | 独立行政法人農林水産消費技術センター等の設立に伴う農林水産省関係省令の整備に関する省令 |
| 六〇 | 3月26日 | 輸出水産業の振興に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 六一 | 3月26日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令 |
| 六二 | 3月26日 | 飼料の安全性の確保及び品質の改善に関する法律に基づく指定検定機関を指定する省令 |
| 六三 | 3月26日 | 家畜改良増殖法に基づく家畜登録機関に関する省令 |
| 六四 | 3月26日 | 卸売市場法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六五 | 3月26日 | 獣医療法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六六 | 3月26日 | 農業災害補償法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 六七 | 3月26日 | 動物用医薬品等取締規則等の一部を改正する省令 |
| 六八 | 3月27日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六九 | 3月27日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七〇 | 3月28日 | 新事業創出促進法第九条第一項の業種を定める省令の一部を改正する省令 |
| 七一 | 3月28日 | 漁業災害補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七二 | 3月30日 | 林業種苗法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七三 | 3月30日 | 遊漁船業の適正化に関する法律に基づく全国遊漁船業協会を指定する省令 |
| 七四 | 3月30日 | 主要食糧の需給及び価格の安定に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 七五 | 3月30日 | 漁船損害等補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七六 | 3月30日 | 肥料取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七七 | 3月30日 | 農薬取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七八 | 3月30日 | 農業機械化促進法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七九 | 3月30日 | 農林水産技術会議事務局組織規則の一部を改正する省令 |
| 八〇 | 3月30日 | 農林漁業団体職員共済組合法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八一 | 3月30日 | 独立行政法人農業技術研究機構法附則第六条第二項の規定による家畜及び家きん専用の血清類及び薬品の製造及び配布に関する省令 |
| 八二 | 3月30日 | 農林漁業団体職員共済組合の財務及び会計に関する省令の一部を改正する省令 |
| 八三 | 3月30日 | 農林水産省組織規則の一部を改正する省令 |
| 八四 | 3月30日 | 農林水産省定員規則の一部を改正する省令 |
| 八五 | 3月30日 | 農林水産省関係研究交流促進法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八六 | 4月2日 | 農山漁村滞在型余暇活動のための基盤整備の促進に関する法律に基づく全国農林漁業体験民宿業協会を指定する省令 |
| 八七 | 4月3日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八八 | 4月11日 | 国有林野の管理経営に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 八九 | 4月11日 | 農業協同組合及び農業協同組合連合会の事業報告書、貸借対照表、損益計算書及び附属明細書の記載方法に関する省令の一部を改正する省令 |
| 九〇 | 4月16日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 九一 | 4月18日 | 農業改良資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九二 | 4月20日 | 指定漁業の許可及び取締り等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 九三 | 4月20日 | ねぎ等に対して暫定的に課する緊急関税に係る特定貨物関税割当制度に関する省令 |
| 九四 | 4月25日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 九五 | 4月25日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 九六 | 4月27日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九七 | 5月9日 | 農地法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九八 | 5月10日 | 肥料取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九九 | 5月11日 | 承認漁業等の取締りに関する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇〇 | 5月23日 | 競馬法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇一-一〇二 | 5月24日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇三 | 5月24日 | 専門技術員資格試験等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇四 | 5月31日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇五 | 6月8日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇六 | 6月13日 | 林業改善資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇七 | 6月29日 | 沿岸漁業等振興法施行令第一条のとう載漁船を定める省令を廃止する省令 |
| 一〇八 | 6月29日 | 漁業再建整備特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇九 | 7月16日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 一一〇 | 7月23日 | 沿岸漁業改善資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一一 | 7月30日 | 指定漁業の許可及び取締り等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一一二 | 7月30日 | 農林水産省組織規則の一部を改正する省令 |
| 一一三 | 7月30日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一一四 | 8月1日 | 水産業協同組合法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一五 | 8月22日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一一六 | 8月27日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一一七 | 8月28日 | 林業経営基盤の強化等の促進のための資金の融通に関する暫定措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一八 | 8月31日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 一一九 | 9月3日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一二〇 | 9月7日 | 農林漁業信用基金の林業等資金暫定業務に関する業務方法書の記載事項を定める省令の一部を改正する省令 |
| 一二一 | 9月7日 | 農林漁業信用基金の農業災害補償関係業務、漁業災害補償関係業務及び林業等資金暫定業務に係る財務及び会計に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一二二 | 9月10日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一二三 | 9月18日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一二四 | 9月21日 | 指定漁業の許可及び取締り等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一二五 | 9月21日 | 瀬戸内海漁業取締規則の一部を改正する省令 |
| 一二六 | 9月21日 | 農地法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一二七 | 9月26日 | 漁業災害補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一二八 | 9月27日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一二九 | 9月28日 | 農林水産省組織規則の一部を改正する省令 |
| 一三〇 | 10月1日 | 独立行政法人農業技術研究機構法附則第六条第二項の規定による家畜及び家きん専用の血清類及び薬品の製造及び配布に関する省令を廃止する省令 |
| 一三一 | 10月12日 | 動物用医薬品の使用の規制に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一三二 | 10月12日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三三 | 10月15日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一三四 | 10月19日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三五 | 10月26日 | 海洋生物資源の保存及び管理に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三六 | 10月31日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三七 | 11月1日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一三八 | 11月9日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一三九 | 11月22日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一四〇 | 11月28日 | 農林畜水産業関係補助金等交付規則の一部を改正する省令 |
| 一四一 | 11月28日 | 森林法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一四二 | 11月29日 | 海面漁業生産統計調査規則の一部を改正する省令 |
| 一四三 | 11月30日 | イモゾウムシの緊急防除に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一四四 | 12月5日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律に基づく登録格付機関等を登録する省令の一部を改正する省令 |
| 一四五 | 12月18日 | 農林水産省組織規則の一部を改正する省令 |
| 一四六 | 12月19日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一四七 | 12月26日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 一四八 | 12月27日 | 農業協同組合法施行規則 |
| 一四九 | 12月27日 | 農業協同組合及び農業協同組合連合会の事業報告書、貸借対照表、損益計算書及び附属明細書の記載方法に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一五〇 | 12月27日 | 農業協同組合及び農業協同組合連合会の行う共済事業に係る責任準備金の積立に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一五一 | 12月27日 | 農業委員会等に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一五二 | 12月27日 | 農業者年金基金法施行規則 |
| 一五三 | 12月27日 | 漁船法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一五四 | 12月28日 | エネルギーの使用の合理化に関する法律第二十五条第六項の規定による立入検査証の様式を定める省令の一部を改正する省令 |
| 一五五 | 12月28日 | 農業者年金基金の業務方法書に記載すべき事項を定める省令 |