平成12年（2000年）農林水産省令
| 一 | 1月4日 | 農林水産省組織規程の一部を改正する省令 |
| 二 | 1月27日 | 肥料取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三 | 1月27日 | 肥料取締法の一部を改正する法律附則第二条に規定する普通肥料に該当する肥料を定める省令 |
| 四 | 1月31日 | 農業災害補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五 | 1月31日 | 都道府県農業共済保険審査会規程施行規則等の一部を改正する省令 |
| 六 | 1月31日 | 農業者年金基金の受託者に対する報告の徴収及び立入検査の結果の報告に関する省令 |
| 七 | 1月31日 | 漁港修築計画に関する基準を定める省令 |
| 八 | 2月1日 | 肥料取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九 | 2月3日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇 | 2月4日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一 | 2月24日 | 森林法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一二 | 2月25日 | 獣医療法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三 | 2月28日 | 社会保障に関する日本国とドイツ連邦共和国との間の協定の実施に伴う農林漁業団体職員共済組合法の特例等に関する省令 |
| 一四 | 2月29日 | 農林水産業施設災害復旧事業費国庫補助の暫定措置に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一五 | 3月1日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一六 | 3月8日 | 海岸、林地荒廃防止施設、地すべり防止施設及び漁港に関し公共土木施設災害復旧事業費国庫負担法を施行する省令の一部を改正する省令 |
| 一七 | 3月15日 | 特定農産加工業経営改善臨時措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一八 | 3月16日 | 農地法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一九 | 3月17日 | 森林法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二〇 | 3月17日 | 農業振興地域の整備に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 二一 | 3月21日 | 農地法施行規則及び農業振興地域の整備に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 二二 | 3月21日 | 獣医師法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 二三 | 3月22日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二四 | 3月22日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 二五 | 3月22日 | 農林漁業信用基金の農業災害補償関係業務に関する業務方法書の記載事項を定める省令 |
| 二六 | 3月22日 | 農林漁業信用基金の漁業災害補償関係業務及び林業等資金暫定業務に係る財務及び会計に関する省令の一部を改正する省令 |
| 二七 | 3月23日 | 天災による被害農林漁業者等に対する資金の融通に関する暫定措置法施行令第十二条第二項の規定による農林水産大臣に対する報告に関する省令 |
| 二八 | 3月23日 | 森林組合法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二九 | 3月24日 | 農林水産省組織規程の一部を改正する省令 |
| 三〇 | 3月24日 | 土地改良法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 三一 | 3月24日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 三二 | 3月27日 | 新事業創出促進法第九条第一項の業種を定める省令の一部を改正する省令 |
| 三三 | 3月29日 | 農業協同組合及び農業協同組合連合会の行う共済事業に係る責任準備金の積立に関する省令の一部を改正する省令 |
| 三四 | 3月29日 | 農業協同組合及び農業協同組合連合会の共済事業に係る財産の運用方法を定める省令の一部を改正する省令 |
| 三五 | 3月30日 | 生物系特定産業技術研究推進機構の研究開発業務に関する業務方法書に記載すべき事項を定める省令及び生物系特定産業技術研究推進機構の研究開発業務に係る財務及び会計に関する省令を廃止する省令 |
| 三六 | 3月30日 | 旧農業に関する技術の研究開発の促進に関する特別措置法第三条に規定する生物系特定産業技術研究推進機構の業務に関する業務方法書に記載すべき事項を定める省令 |
| 三七 | 3月30日 | 生物系特定産業技術研究推進機構の基礎的研究業務に係る重要な財産の処分等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 三八 | 3月30日 | 家畜商法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三九 | 3月30日 | 農業振興地域の整備に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 四〇 | 3月30日 | 肉用子牛生産安定等特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四一 | 3月31日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四二 | 3月31日 | 品種登録規則の一部を改正する省令 |
| 四三 | 3月31日 | 農業災害補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四四 | 3月31日 | 農業者大学校組織規程の一部を改正する省令 |
| 四五 | 3月31日 | 農林水産省組織規程の一部を改正する省令 |
| 四六 | 3月31日 | 農林水産省定員規則の一部を改正する省令 |
| 四七 | 3月31日 | 過疎地域自立促進特別措置法第二十六条の農林漁業の経営改善又は振興のための計画に関する省令 |
| 四八 | 3月31日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四九 | 3月31日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五〇 | 3月31日 | 農林業センサス規則の一部を改正する省令 |
| 五一 | 3月31日 | 漁業センサス規則の一部を改正する省令 |
| 五二 | 3月31日 | 動物用医薬品等手数料規則 |
| 五三 | 3月31日 | 競馬法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五四 | 3月31日 | 砂糖の価格安定等に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 五五 | 3月31日 | 農林漁業団体職員共済組合法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五六 | 3月31日 | 沖縄の復帰に伴う農林水産省令の適用の特別措置等に関する省令の一部を改正する省令の一部を改正する省令 |
| 五七 | 4月10日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五八 | 5月9日 | 大豆なたね交付金暫定措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五九 | 5月12日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 六〇 | 5月17日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六一 | 5月17日 | 沿岸漁業改善資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六二 | 5月18日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六三 | 5月19日 | 農業委員会等に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 六四 | 5月26日 | 農産物検査法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六五 | 5月30日 | 承認漁業等の取締りに関する省令の一部を改正する省令 |
| 六六 | 5月31日 | 農林水産省組織規程の一部を改正する省令 |
| 六七 | 5月31日 | 動物用医薬品の使用の規制に関する省令の一部を改正する省令 |
| 六八 | 5月31日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 六九 | 6月2日 | 野菜供給安定基金の財務及び会計に関する省令の一部を改正する省令 |
| 七〇 | 6月9日 | 農林物資の規格化及び品質表示の適正化に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 七一 | 6月27日 | 土地改良法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 七二 | 6月29日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七三 | 6月30日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七四 | 7月3日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 七五 | 7月17日 | 飼料及び飼料添加物の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 七六 | 7月28日 | 生糸調査規則の一部を改正する省令 |
| 七七 | 7月31日 | 農林業センサス規則の一部を改正する省令 |
| 七八 | 8月10日 | 主要食糧の需給及び価格の安定に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 七九 | 8月30日 | 農業改良資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八〇 | 8月30日 | 植物防疫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八一 | 8月31日 | 肥料取締法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八二 | 9月1日 | 中央省庁等改革のための農林水産省関係省令の整備に関する省令 |
| 八三 | 9月6日 | 砂糖の価格安定等に関する法律及び農畜産業振興事業団法の一部を改正する法律等の施行に伴う関係農林水産省令の整備に関する省令 |
| 八四 | 9月20日 | 農業共済再保険特別会計法施行令第五条ノ二第一項の規定に基づく農作物共済、蚕繭共済、果樹共済及び畑作物共済に係る再保険金の概算払の額の限度に関する省令の一部を改正する省令 |
| 八五 | 9月26日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八六 | 9月28日 | 農林水産省組織規程の一部を改正する省令 |
| 八七 | 9月28日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八八 | 9月28日 | 農業災害補償法施行規則の一部を改正する省令 |
| 八九 | 9月29日 | 青年等の就農促進のための資金の貸付け等に関する特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九〇 | 9月29日 | 農業改良資金助成法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九一 | 10月23日 | 動物用医薬品等取締規則の一部を改正する省令 |
| 九二 | 10月31日 | 農林畜水産業関係補助金等交付規則の一部を改正する省令 |
| 九三 | 11月7日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九四 | 11月22日 | 動物用医薬品の使用の規制に関する省令の一部を改正する省令 |
| 九五 | 11月27日 | 指定漁業の許可及び取締り等に関する省令及び承認漁業等の取締りに関する省令の一部を改正する省令 |
| 九六 | 11月28日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九七 | 11月28日 | 組合又はその子会社が所有する株式等に含めない株式等を定める省令の一部を改正する省令 |
| 九八 | 11月29日 | 農林中央金庫法施行規則の一部を改正する省令 |
| 九九 | 11月29日 | 卸売市場法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇〇 | 11月29日 | 品種登録規則の一部を改正する省令 |
| 一〇一 | 11月30日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇二 | 12月1日 | イモゾウムシの緊急防除に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇三 | 12月5日 | 畜産物の価格安定等に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇四 | 12月15日 | 製材統計調査規則の一部を改正する省令 |
| 一〇五 | 12月19日 | 主要食糧の需給及び価格の安定に関する法律施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇六 | 12月22日 | 農林水産省定員規則を廃止する省令 |
| 一〇七 | 12月25日 | 農産物検査法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一〇八 | 12月27日 | 動物用医薬品の使用の規制に関する省令の一部を改正する省令 |
| 一〇九 | 12月28日 | 家畜伝染病予防法施行規則の一部を改正する省令の一部を改正する省令 |