平成12年（2000年）運輸省令
| 一 | 1月17日 | 航空法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二 | 1月20日 | 気象庁組織規則の一部を改正する省令 |
| 三 | 2月3日 | 海上における人命の安全のための国際条約及び満載喫水線に関する国際条約による証書に関する省令等の一部を改正する省令 |
| 四 | 2月9日 | モーターボート競走法施行規則の一部を改正する省令 |
| 五 | 2月21日 | 道路運送車両の保安基準等の一部を改正する省令 |
| 六 | 2月23日 | 海上衝突予防法施行規則の一部を改正する省令 |
| 七 | 3月1日 | 鉄道事業法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 八 | 3月2日 | 民法の一部を改正する法律及び民法の一部を改正する法律の施行に伴う関係法律の整備等に関する法律の施行に伴う運輸省関係省令の整備に関する省令 |
| 九 | 3月22日 | 運輸省関係手数料等の改定等に関する省令 |
| 一〇 | 3月24日 | 港則法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一一 | 3月24日 | 地方分権の推進を図るための関係法律の整備等に関する法律及び地方分権の推進を図るための関係法律の整備等に関する法律の施行に伴う運輸省関係政令の整備等に関する政令の施行に伴う運輸省関係省令の整備に関する省令 |
| 一二 | 3月28日 | 水先法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一三 | 3月29日 | 特定都市鉄道整備促進特別措置法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一四 | 3月29日 | 旅行業法施行規則の一部を改正する省令 |
| 一五 | 3月30日 | 港湾運送事業会計規則等の一部を改正する省令 |
| 一六 | 3月30日 | 運輸省組織規程等の一部を改正する省令 |
| 一七 | 3月30日 | 海事代理士法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 一八 | 3月31日 | 運輸省定員規則の一部を改正する省令 |
| 一九 | 3月31日 | 港湾法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二〇 | 5月17日 | 海上災害防止センターの財務及び会計に関する省令の一部を改正する省令 |
| 二一 | 6月23日 | 気象業務法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二二 | 6月26日 | 核原料物質、核燃料物質及び原子炉の規制に関する法律の規定に基づく立入検査をする職員の携帯する身分を示す証明書の様式を定める省令及び実用舶用原子炉の設置、運転等に関する規則の一部を改正する省令 |
| 二三 | 6月28日 | 海難審判法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二四 | 6月30日 | モーターボート競走法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二五 | 7月3日 | 道路運送車両法施行規則及び自動車の登録及び検査に関する申請書等の様式等を定める省令の一部を改正する省令 |
| 二六 | 7月13日 | 港則法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二七 | 7月31日 | 航空法の一部を改正する法律の施行に伴う経過措置を定める省令 |
| 二八 | 8月10日 | 航空法施行規則の一部を改正する省令 |
| 二九 | 8月31日 | 航空法の一部を改正する法律の施行に伴う経過措置を定める省令の一部を改正する省令 |
| 三〇 | 9月1日 | 海上運送法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 三一 | 9月5日 | 道路運送車両の保安基準の一部を改正する省令 |
| 三二 | 9月28日 | 経営安定基金に係る経理の整理に関する省令の一部を改正する省令 |
| 三三 | 9月29日 | 港湾法施行規則の一部を改正する省令 |
| 三四 | 9月29日 | 港湾運送事業法施行規則等の一部を改正する省令 |
| 三五 | 10月13日 | 自動車整備士技能検定規則の一部を改正する省令 |
| 三六 | 10月27日 | 海洋汚染及び海上災害の防止に関する法律の一部を改正する法律の一部の施行に伴う経過措置を定める省令 |
| 三七 | 11月10日 | 高齢者、身体障害者等の公共交通機関を利用した移動の円滑化の促進に関する法律第二十一条第一項第一号に規定する移動円滑化のための事業を定める省令 |
| 三八 | 11月28日 | 危険物船舶運送及び貯蔵規則等の一部を改正する省令 |
| 三九 | 11月29日 | 中央省庁等改革のための国土交通省関係運輸省令等の整備に関する省令 |
| 四〇 | 11月29日 | 中央省庁等改革に伴い運輸省関係省令を廃止する省令 |
| 四一 | 12月8日 | 海上交通安全法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四二 | 12月22日 | 航空法施行規則の一部を改正する省令 |
| 四三 | 12月22日 | 油又は有害液体物質による海洋の汚染の防止のために使用する薬剤の技術上の基準を定める省令 |
| 四四 | 12月25日 | 運輸省定員規則を廃止する省令 |
| 四五 | 12月25日 | 沖縄の復帰に伴う運輸省令の適用の特別措置等に関する省令の一部を改正する省令 |
| 四六 | 12月25日 | 核燃料物質等車両運搬規則の一部を改正する省令 |
| 四七 | 12月26日 | 行政機関の保有する情報の公開に関する法律の施行に伴う関係法律の整備等に関する法律の施行に伴う運輸省関係省令の整備に関する省令 |
| 四八 | 12月26日 | 港湾法施行規則及び港湾計画の基本的な事項に関する基準を定める省令の一部を改正する省令 |
| 四九 | 12月27日 | 船舶設備規程の一部を改正する省令【番号正誤訂正（平成12年12月28日正誤欄）】 |