平成11年（1999年）人事院規則
| 一〇-一一-一 | 1月20日 | 人事院規則一〇-一一（育児又は介護を行う職員の深夜勤務の制限）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-三七 | 1月29日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 一〇-七-四 | 1月29日 | 人事院規則一〇-七（女子職員及び年少職員の健康、安全及び福祉）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四九-一一 | 2月8日 | 人事院規則九-四九（調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-四八 | 2月8日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇五-三 | 2月26日 | 人事院規則九-一〇五（ハワイ観測所勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-七二 | 3月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 八-一八-一三 | 3月2日 | 人事院規則八-一八（採用試験）の一部を改正する人事院規則 |
| 一五-一四-八 | 3月9日 | 人事院規則一五-一四（職員の勤務時間、休日及び休暇）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-五三 | 3月19日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇五-四 | 3月31日 | 人事院規則九-一〇五（ハワイ観測所勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 二-三-一七 | 4月1日 | 人事院規則二-三（人事院事務総局の組織）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一-一六 | 4月1日 | 人事院規則九-一（非常勤職員の給与）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二-三二 | 4月1日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-三六 | 4月1日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-三八 | 4月1日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-七三 | 4月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-三〇-三八 | 4月1日 | 人事院規則九-三〇（特殊勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六八-六 | 4月1日 | 人事院規則九-六八（義務教育等教員特別手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一一-八-一二 | 4月1日 | 人事院規則一一-八（職員の定年）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-〇-二六 | 4月1日 | 人事院規則一六-〇（職員の災害補償）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-三-二八 | 4月1日 | 人事院規則一六-三（災害を受けた職員の福祉事業）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-五五-四九 | 4月30日 | 人事院規則九-五五（特地勤務手当等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一七-〇-五四 | 6月25日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-二-三三 | 7月1日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-三九 | 7月1日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一七-七四 | 7月1日 | 人事院規則九-一七（俸給の特別調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四九-一二 | 7月13日 | 人事院規則九-四九（調整手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-二五 | 9月20日 | 国家公務員倫理法（平成十一年法律第百二十九号）の施行に伴う関係人事院規則の整備に関する人事院規則 |
| 二-一〇 | 9月20日 | 国家公務員倫理審査会事務局の組織 |
| 一七-〇-五五 | 9月24日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-九-三 | 9月29日 | 人事院規則一-九（沖縄の復帰に伴う国家公務員法等の適用の特別措置等）の一部を改正する人事院規則 |
| 一二-〇-一 | 9月29日 | 人事院規則一二-〇（職員の懲戒）の一部を改正する人事院規則 |
| 一〇-四-八 | 10月1日 | 人事院規則一〇-四（職員の保健及び安全保持）の一部を改正する人事院規則 |
| 一六-四-一八 | 10月1日 | 人事院規則一六-四（補償及び福祉事業の実施）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-二六 | 10月25日 | 国家公務員法等の一部を改正する法律（平成十一年法律第八十三号）の施行に伴う関係人事院規則の整備に関する人事院規則 |
| 九-一〇七 | 10月25日 | 再任用短時間勤務職員の俸給月額の端数計算 |
| 一一-九 | 10月25日 | 定年退職者等の再任用 |
| 九-二-三四 | 11月25日 | 人事院規則九-二（俸給表の適用範囲）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-六-三七 | 11月25日 | 人事院規則九-六（俸給の調整額）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-八-四〇 | 11月25日 | 人事院規則九-八（初任給、昇格、昇給等の基準）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一五-一一 | 11月25日 | 人事院規則九-一五（宿日直手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-四〇-一六 | 11月25日 | 人事院規則九-四〇（期末手当、勤勉手当及び期末特別手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇八 | 11月25日 | 平成十一年改正法附則第三項の規定による最高の号俸を超える俸給月額を受ける職員の俸給の切替え等 |
| 九-一〇九 | 11月25日 | 平成十一年改正法附則第十項の規定による最高号俸等を受ける職員の俸給の切替え等 |
| 一四-四-五 | 11月25日 | 人事院規則一四-四（営利企業への就職）の一部を改正する人事院規則 |
| 一四-八-二 | 11月25日 | 人事院規則一四-八（営利企業の役員等との兼業）の一部を改正する人事院規則 |
| 一九-〇-二 | 11月25日 | 人事院規則一九-〇（職員の育児休業等）の一部を改正する人事院規則 |
| 九-一〇五-五 | 11月30日 | 人事院規則九-一〇五（ハワイ観測所勤務手当）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-〇-一 | 12月22日 | 人事院規則一-〇（規則の法的根拠）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-一-一 | 12月22日 | 人事院規則一-一（規則の分類）の一部を改正する人事院規則 |
| 一-二-一 | 12月22日 | 人事院規則一-二（用語の定義）の一部を改正する人事院規則 |
| 二-三-一八 | 12月22日 | 人事院規則二-三（人事院事務総局の組織）の一部を改正する人事院規則 |
| 二-一一 | 12月22日 | 交流審査会 |
| 二一-〇 | 12月22日 | 国と民間企業との間の人事交流 |
| 一七-〇-五六 | 12月24日 | 人事院規則一七-〇（管理職員等の範囲）の一部を改正する人事院規則 |