平成11年（1999年）総理府令
| 一 | 1月11日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 二 | 1月11日 | 銃砲刀剣類所持等取締法施行規則等の一部を改正する総理府令 |
| 三 | 1月22日 | 内閣及び総理府の所管に属する補助金等の事務委任の範囲及びその委任を受ける者を定める総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 四 | 1月27日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五 | 2月15日 | 地域振興整備公団の地方都市開発整備等業務及び工業再配置等業務に係る財務及び会計に関する総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 六 | 2月24日 | 核燃料物質等の工場又は事業所の外における運搬に関する規則の一部を改正する総理府令 |
| 七 | 2月26日 | 災害対策基本法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 八 | 3月5日 | 方面総監部及び師団司令部組織規則等の一部を改正する総理府令 |
| 九 | 3月10日 | 内閣及び総理府所管旅費取扱規則及び警察庁旅費取扱規則の一部を改正する総理府令 |
| 一〇 | 3月12日 | 悪臭防止法施行規則等の一部を改正する総理府令 |
| 一一 | 3月15日 | 道路交通法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 一二 | 3月15日 | 絶滅のおそれのある野生動植物の種の保存に関する法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 一三 | 3月26日 | 経済企画庁組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 一四 | 3月26日 | 経済研究所組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 一五 | 3月29日 | 試験研究の用に供する原子炉等の設置、運転等に関する規則等の一部を改正する総理府令 |
| 一六 | 3月30日 | 科学技術研究調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 一七 | 3月30日 | 科学技術庁組織規則等の一部を改正する総理府令 |
| 一八 | 3月31日 | 総理府本府組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 一九 | 3月31日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 二〇 | 3月31日 | 風俗営業等の規制及び業務の適正化等に関する法律に基づく許可申請書の添付書類等に関する総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 二一 | 3月31日 | 総務庁組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 二二 | 3月31日 | 北海道開発庁組織規則及び北海道開発局組織規程の一部を改正する総理府令 |
| 二三 | 3月31日 | 防衛庁職員給与施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 二四 | 3月31日 | 参事官等俸給表の指定職の欄の適用を受ける参事官及び書記官の官職並びにこれらに準ずる事務官等及び自衛官の官職を定める総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 二五 | 3月31日 | 環境庁組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 二六 | 3月31日 | 建築物用地下水の採取の規制に関する法律施行規則等の一部を改正する総理府令 |
| 二七 | 4月1日 | 公正取引委員会事務総局組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 二八 | 4月1日 | 警察庁旅費取扱規則の一部を改正する総理府令 |
| 二九 | 4月1日 | 沖縄総合事務局組織規程の一部を改正する総理府令 |
| 三〇 | 4月1日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 三一 | 4月7日 | 地球温暖化対策の推進に関する法律施行規則 |
| 三二 | 5月6日 | 事業所・企業統計調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 三三 | 5月19日 | 金融再生委員会組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 三四 | 5月20日 | 沖縄総合事務局組織規程の一部を改正する総理府令 |
| 三五 | 6月4日 | サービス業基本調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 三六 | 6月4日 | 環境事業団法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 三七 | 6月11日 | 防衛庁が行う飛行場及びその施設の設置又は変更の事業に係る環境影響評価の項目並びに当該項目に係る調査、予測及び評価を合理的に行うための手法を選定するための指針、環境の保全のための措置に関する指針等を定める総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 三八 | 6月18日 | 全国消費実態調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 三九 | 6月25日 | 金融再生委員会組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 四〇 | 7月28日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 四一 | 8月19日 | 道路交通法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 四二 | 8月20日 | 内閣及び総理府所管旅費取扱規則の一部を改正する総理府令 |
| 四三 | 9月14日 | 鳥獣保護及狩猟ニ関スル法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 四四 | 9月30日 | 海外経済協力基金の財務及び会計に関する総理府令を廃止する総理府令 |
| 四五 | 9月30日 | 国際協力銀行法第二十六条第一項の実施方針に関する総理府令 |
| 四六 | 9月30日 | 試験研究の用に供する原子炉等の設置、運転等に関する規則等の一部を改正する総理府令 |
| 四七 | 9月30日 | 環境事業団法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 四八 | 9月30日 | 環境事業団の業務方法書に関する命令の一部を改正する総理府令 |
| 四九 | 9月30日 | 沖縄総合事務局組織規程の一部を改正する総理府令 |
| 五〇 | 9月30日 | 地域振興整備公団の地方都市開発整備等業務及び工業再配置等業務に係る財務及び会計に関する総理府令の一部を改正する総理府令 |
| 五一 | 9月30日 | 首都圏の近郊整備地帯及び都市開発区域の整備に関する法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五二 | 9月30日 | 近畿圏の近郊整備区域及び都市開発区域の整備及び開発に関する法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五三 | 9月30日 | 首都圏の既成市街地における工業等の制限に関する法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五四 | 10月15日 | 小売物価統計調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 五五 | 10月15日 | 労働力調査規則の一部を改正する総理府令 |
| 五六 | 11月17日 | 農地被買収者等に対する給付金の支給に関する法律施行規則を廃止する総理府令 |
| 五七 | 11月17日 | 引揚者等に対する特別交付金の支給に関する法律施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五八 | 11月19日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 五九 | 11月19日 | 沖縄総合事務局組織規程の一部を改正する総理府令 |
| 六〇 | 11月24日 | 首都圏の近郊整備地帯及び都市開発区域の整備に関する法律施行規則等の一部を改正する総理府令 |
| 六一 | 11月25日 | 防衛庁の職員の俸給の切替え及び切替えに伴う措置に関する総理府令 |
| 六二 | 11月25日 | 防衛庁職員給与施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 六三 | 12月8日 | 金融再生委員会組織規則の一部を改正する総理府令 |
| 六四 | 12月16日 | 試験研究の用に供する原子炉等の設置、運転等に関する規則等の一部を改正する総理府令 |
| 六五 | 12月20日 | 内閣及び総理府所管旅費取扱規則等の一部を改正する総理府令 |
| 六六 | 12月24日 | 警察法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 六七 | 12月27日 | ダイオキシン類対策特別措置法施行規則 |
| 六八 | 12月28日 | 自動車安全運転センター法施行規則の一部を改正する総理府令 |
| 六九 | 12月28日 | 地価公示法第二条第一項の都市計画区域を定める省令の一部を改正する総理府令 |